- Zakład Auksetyków, Materiałów Funkcjonalnych i Symulacji Komputerowych (ZN1)kierownik: prof. dr hab. Konstantin Tretiakov
- Zakład Teorii Nanostruktur i Materiałów Kwantowych (ZN2)kierownik: dr hab. Andrzej Szajek, prof. IFM PAN
- Zakład Cienkich Warstw i Nanostruktur (ZN3)kierownik: dr hab. Piotr Kuświk, prof. IFM PAN
- Zakład Fizyki Niskich Temperatur, Materiałów i Technologii Kwantowych (ZN4)kierownik: prof. dr hab. Zbigniew Trybuła
- Zakład Fizyki Magnetyków (ZN5)kierownik: prof. dr hab. Tomasz Toliński
- Zakład Fizyki Ciekłych Kryształów i Układów Dielektrycznych (ZN6)kierownik: prof. dr hab. Arkadiusz Brańka
- Zakład Kryształów Molekularnych (ZN7)kierownik: dr hab. Andrzej Łapiński, prof. IFM PAN
- Zakład Fizyki Układów Molekularnych i Badań Radiospektroskopowych (ZN8)kierownik: dr hab. Michał Bielejewski, prof. IFM PAN